水文地质勘察工作与国民经济建设密切相关，主要研究地下水的物理性质、化学成分、形成规律、地下水资源分布与合理利用、地下水对工程建设和矿产资源开采的影响与防治等相关内容。水文地质勘察的工作内容包括:
①水文地质测绘。
对地下水和与其有关的各种地质现象进行实地观测和填图工作，包括收集有关的资料;布置观测点和观测线进行实地调查;测定井、泉等地下水露头的流量和水质;研究其形成条件，以查明地下水的形成、分布、埋藏条件和岩土的含水性;寻找地下水的富水地段，选定进一步勘探和试验工作的地点等。利用遥感技术，对卫星照片和航空照片进行解译，以配合水文地质测绘，是一种又快又好的方法，可以提高地面测绘的效率和精度。
②地球物理勘探。
地球物理勘探(简称物探)常用来寻找地下水，确定含水层的位置，划分咸水体和淡水体界线等。在水文地质勘探中常用的地面物探方法有电测深法、电剖面法、自然电场法、浅层地震法、α-径迹法等。常用的钻井地球物理方法有电测井法、放射性测井法等。物探方法由于比较快速、经济，常与水文地质钻探和试验配合进行，利用物探确定钻孔和抽水试验地点，可以提高效率。
③水文地质钻探。
钻探的目的是确定含水层的位置与分布，以查明地下水的存在条件。所获岩心要进行详细编录，并且利用钻孔进行抽水试验或其他水文地质试验。水文地质钻探的要求和一般的矿产钻探不同，要求有较大的孔径并且用清水钻进。否则利用钻孔求得的水文地质参数可能失真。
④水文地质试验。
水文地质试验的目的是取得各种参数，为地下水资源评价或矿山涌水量计算等提供基础资料，包括抽水试验、压水试验、注水试验和弥散试验等，最常用的是抽水试验。
⑤地下水动态观测。
地下水动态观测是水文地质勘察的一项重要内容。在布置钻探和水文地质试验时，就要考虑到保留一部分钻孔用来进行长期观测，定期测定地下水的水位、水质和水温，以便为以后的地下水资源评价或其他水文地质计算提供基础资料。一般要求动态观测的时间不少于一个水文年，时间系列愈长愈好。
⑥实验室分析。
在水文地质勘察过程中，要选取水样、岩样或土样进行实验室的水质分析、粒度分析、孢粉或微体古生物分析、同位素年龄测定等。
自我院成立以来，水文地质始终为院主营业务之一，经多年的发展，培养了一批中高级职称的水文地质专业技术人员，我院水文地质专业技术力量在海南省名列前茅。我院近些年开展了《海口江东新区综合地质调查--琼中水文地质钻探》等多个水文地质相关项目，项目成果也得到中国地质调查局和自然资源部等相关部门领导认可与肯定。我院当前主要承接水文地质调查、水文地质钻探、水文地质试验（抽水试验）、地下水动态观测、矿泉水及热矿泉水勘探评价、水资源论证等业务。
